إدراكا منها بأهمية ودور البحث العلمي والتقني في تنمية القطاعين الاقتصادي والصناعي على الصعيدين الوطني والجهوي؛ بذلت جامعة مولاي إسماعيل جهودا هامة للرفع من مستوى البحث بها وجعله قادرا على خوض التحديات التي يشهدها هذا القطاع خلال الظرفية الحالية.

في هذا الإطار، حرصت جامعتنا، ضمن الاستراتيجية الوطنية لتنمية البحث العلمي، على إعادة تنظيم وهيكلة البحث العلمي، بحيث تنتظم هياكل البحث فيها في منظومة الفرق والمختبرات اعتمادا على برنامج الهيكلة الذي تبنته الوزارة الوصية، وبذلك كانت الانطلاقة خلال سنة 2005 لتنظيم مختبرات وفرق البحث بالمؤسسات التابعة للجامعة. وتواصلت هذه العملية منذ ذلك الحين إلى الموسم الجامعي 2012-2013، حيث تم اعتماد 161 بنية بحث (142 فريف بحث و19 مختبرا للبحث) تضم مختلف المجالات والتخصصات العلمية.

بالإضافة إلى المختبرات وفرق البحث، تعتزم جامعة مولاي إسماعيل إنشاء مراكز البحث متعددة التخصصات التي سوف تساعد لا محالة على تشجيع التميز وتلبية الاحتياجات الحقيقية في البحث والتكوين.